1、養(yǎng)分含量低

與養(yǎng)分單一的化肥相比是優(yōu)點，但是它的養(yǎng)分含量低，也存在供應(yīng)不平衡問題，不能滿足作物高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、增收的需要。在施用有機肥時應(yīng)根據(jù)作物對養(yǎng)分的要求配施不同比例化肥，做到平衡施肥。

2、肥效遲緩

在有機肥施用量不是很大的情況下，很難滿足農(nóng)作物對營養(yǎng)元素的需要。因此，要利用化肥養(yǎng)分含量高，肥效迅速的優(yōu)點，將有機肥與化肥配合施用，緩急相濟，取長補短，發(fā)揮混合優(yōu)勢，滿足農(nóng)作物生長發(fā)育過程中對各種營養(yǎng)元素在數(shù)量和時間上的需求。

3、需經(jīng)過發(fā)酵處理

許多（糞）有機肥料帶有病菌、蟲卵和雜草種子，還有些有機肥料中含有不利于作物生長的有機化合物，所以，有機肥必須經(jīng)過高質(zhì)量發(fā)酵、加工處理后才能施用，生糞絕不能下地。

4、不同作物，區(qū)別施用

應(yīng)根據(jù)種植土壤的質(zhì)地、氣候以及種植作物的生長習(xí)性、需肥特性，選擇合適的有機肥料進行合理施肥。例如：人糞尿中含有大量的氯離子，對氯敏感作物應(yīng)避免施用。

5、并不是越多越好

在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中也存在計量施用的問題。如果有機肥的用量太多，不僅是一種浪費，而且也可造成土壤障礙，影響作物生長發(fā)育。應(yīng)根據(jù)土壤中各種養(yǎng)分及有機質(zhì)的消耗情況合理使用，做到配方施肥、科學(xué)施肥。

6、施用方法要得當(dāng)

有機肥（果樹）應(yīng)采用開溝條施或挖坑穴施，進行集中施肥，施后及時覆土；若采用撒施，施后應(yīng)翻入土壤。一般大田作物均做底肥。將有機肥與化肥混合施用，效果更佳。如過磷酸鈣與有機肥拌施，能大大提高肥效。

7、不宜與堿性肥料混用

腐熟的有機肥不宜與堿性肥料混用，若與堿性肥料混合，會造成氨的揮發(fā)，降低有機肥肥