有機生物肥料能提高土壤肥力，這是它的主要作用，如各種固氮菌肥料，可以增加土壤中的氮素來源，解磷解鉀菌肥料可以將土壤中難溶性的磷、鉀溶解出來，增加土壤中磷(P)、鉀(K)元素的來源。另外，生物肥料還能促進作物的生長，改善農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)。各種生物肥施入土壤中，都能產(chǎn)生不同的生長激素，刺激作物的生長，如“5406”放線菌生物肥，不但有拮抗病原菌防病壯菌的作用，還能分泌細胞分裂素促進作物的生長。真菌類的生物肥不僅在協(xié)助作物吸收磷、鋅及銅等礦質(zhì)元素方面有很強的作用，還有增強作物的吸水、保水以提高作物抗旱能力的作用。由于生物肥料能制造和協(xié)助作物吸收利用多種營養(yǎng)元素，因此對農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)有很大的改善，可以改變因施化肥產(chǎn)生的“瓜不香，果不甜，茶無味”的現(xiàn)狀，使農(nóng)產(chǎn)品各項指標達到 綠色食品的標準。